Testy Kariotype versus Microarray w poszukiwaniu nieprawidłowości genetycznych po urodzeniu martwego dziecka AD 8

To, czy te warianty są patogenne, pozostaje do ustalenia. Girirajan i koledzy [18] donieśli ostatnio, że dzieci, które mają dwa duże warianty o nieznanym znaczeniu klinicznym, osiem razy częściej mają opóźnienie rozwojowe niż kontrole od ogólnej populacji. Wykryliśmy nierównowagę genomu w regionie 22q11.2 w trzech przypadkach w analizie mikromacierzy, ale nie w analizie kariotypu. Mikrodelecje w regionie 22q11.2 są związane z zespołem DiGeorge, a mikropłytki powodują zespół 22q11.2 mikroduplication. Fenotyp obu zespołów jest zmienny, ze wspólnymi anomaliami klinicznymi, które obejmują wady serca, nieprawidłowości układu moczowo-płciowego i niewydolność krtani.27-29 Częstość występowania zespołu DiGeorge a szacuje się na przypadek po urodzeniu 4000.30 Zespół 22-11,2 mikroduplication wydaje się być mniej powszechny. Wykryliśmy trzy warianty wielkości 500 kb lub więcej w typowym regionie 22q11.2 i typową delecję DiGeorge (2,8 Mb) w martwym ciele, który nie był uwzględniony w pierwotnej analizie, ponieważ nie podjęto prób wykonania kariotypu. Trzy martwe narodziny z patogennym wariantem w regionie 22q11.2 reprezentują wzrost częstości występowania tej nieprawidłowości o czynnik 22,6 (P = 3,5 × 10-4) w porównaniu z częstością w populacji ogólnej (1 na 4000 urodzenia). Jeśli policzymy wszystkie cztery warianty w regionie 22q11.2 i 41 martwych urodzeń, które przeszły analizę mikromacierzy, ale nie analizy kariotypu, częstość występowania zwiększa się o współczynnik 27,3 (P = 1,5 x 10-5). Wyniki te sugerują, że nierównowagi genomiczne w tym regionie mogą wiązać się z martwym porodem. Identyfikacja wariantu 22q11.2 w urodzenie martwego dziecka jest ważna, ponieważ zespół DiGeorge a jest zaburzeniem polegającym na haploinsuficiency, w którym zaleca się badanie rodziców.30 Ryzyko nawrotu w kolejnych ciążach wzrasta z poziomu poniżej 0,1% dla rodziców normalnych pod względem genotypu do 50%, jeśli rodzic ma delecję.30 W niektórych przypadkach potomstwo dotknięte chorobą może służyć jako wskaźnik indeksu prowadzący do rozpoznania u rodzica z delecją 22q11.2, która ma łagodny kliniczny fenotyp.30
Istnieją ograniczenia technologii opartej na mikromacierzy. Prawdziwie zrównoważone przegrupowania nie mogą być wykryte przy analizie mikromacierzy; są jednak mało prawdopodobne, aby powodowały martwy poród. Ponadto, mozaikę niskiego poziomu wykrytą za pomocą kariotypowania nie wykryto w analizie mikromacierzy w naszym badaniu, chociaż kliniczne implikacje tego mozaiki niskiego poziomu są niejasne.
Równoczesne badanie kariotypu i mikromacierzy na tych samych tkankach byłoby idealne. Nie było to jednak możliwe, ponieważ projekt badania wymagał kariotypowania w czasie rzeczywistym. Kolejnym ograniczeniem była nasza niezdolność do odróżnienia de novo od dziedzicznych wariantów z powodu niedostępności rodzicielskiego DNA Warianty De novo w klinicznie znaczących regionach genów są bardziej prawdopodobne. Jednak odziedziczone patogenne warianty nie powinny być dyskontowane jako przyczyna martwego urodzenia z powodu ich zmiennej ekspresji i niepełnej penetracji.8,26 Nasza zdolność do oceny zamkniętego mozaiki łożyskowej, w której płód jest genetycznie normalny, ale łożysko jest genetycznie nieprawidłowe, była ograniczona .
Główną siłą naszych badań była duża, zróżnicowana geograficznie i rasowo, populacyjna seria kobiet z urodzenia martwiczym.5 Wszystkie martwe noworodki, które uwzględniono w analizie, były dokładnie fenotypowane, ponieważ kobiety wyraziły zgodę na pełną ocenę, w tym płód. badanie pośmiertne, analiza patologiczna łożyska, kariotypowanie i badanie matki i płodu.31 Analizę mikromacierzy przeprowadzono w instytucji, która nie była częścią badania, a badacze, którzy przeprowadzili analizę, nie byli świadomi wyników kariotypowania i historii klinicznej.
Podsumowując, stwierdziliśmy, że analiza mikromacierzy może być przydatna w przypadkach martwego urodzenia, gdy nie można uzyskać wyników badań kariotypowych lub w przypadkach, w których występują wrodzone anomalie. Analiza metodą mikromacierzy jest droższa od standardowej analizy kariotypu, chociaż jej koszt prawdopodobnie spadnie26 i może zostać zrekompensowany wyższym wynikiem nieprawidłowości genomicznych.
[podobne: femiferal, medyk częstochowa, erdomed ulotka ]